石斋 东门屿上有个鹰石洞，黄道周少年时，于此读书修炼，洞中石壁有其刻写的星象图。民国四年（1915）四月，许世英（1874—1964, 字静仁, 号俊人,安徽省东至县许村人，清末举人, 民国巡按使。）南巡铜山时，偕许兆桂、俞绍×、胡韫玉、徐时霞、王绍祈、于胥乐，于鹰嘴石上镌刻“石斋” 两个大字，楷书，“石” 字高0.50米，宽0.45米；“斋” 字高0.58米，宽0.50米，横写。旁有许世英题刻数行楷书小字：“先生节义，照耀古今。石室荒凉，仅存遗址。鱼跃鸢飞，具见大道。谨署二字，以昭后人。”                                     

磐涧 明代题刻。 明阁部路振飞，题刻于东门屿云山石室后面石壁上。楷书，每字高0.70米，宽0.60米左右，横写。磐涧，出于《诗经》：“考磐在涧”，喻云山石室是贤者隐处。

印心 题刻东明寺左边山坡石壁上，副题：“相传宋帝渡海登岛洗心于此·寂富 ”。 后人曾释之, 僧人寂富运用佛家语“印心”， 含有顿然破除妄念，觉悟真理之意。

达观 作者不详。 题刻于东门屿云山石室外石壁上。

海东佛国  作者，浙江奉化灵宝寺住持。题刻于东明寺前岩石上。

闲乐居 作者，长林寺僧道宗。题刻于东明寺前石洞口。

海空即道 作者，湖北比丘法演。题刻于东明寺前壁上。

正觉圆明 作者不详。题刻东门屿东明寺左边石壁上。

福海聚无量 作者，香港孙钜英，题刻于东明寺左前方海滨岩石上。

中流聚心得 作者不详。题刻于东明寺右前方海滨岩石上。       

回头是岸 副题：“丙子年夏九华山人”。题刻于东明寺前方海滨岩石上。

云山石室 明代题刻。 位于东门屿南澳岭上黄道周读书处岩洞口石壁上，行书，每字高0.30—0.36米，宽0.30米，横写。隐若在巨石和绿树之中，衬托了石室的简陋而悠闲。

石室由三四块巨石纵横重叠而成，面积约有20平方米，可纳20余人，黄道周亲笔题刻“云山石室”四个大字，石室外的石壁上刻有明朝巡抚路振飞题字的“磐涧”二字，另一侧有“达观”题刻，石室前竖着一座石华表，南面横额题“黄道周先生读书处”，北面额书“高山仰止”，华表两侧刻有对联：“仰止高山已表儒林首出，溯游学海群推道岸先登。”这是清乾隆十六年（1751），巡抚潘思榘巡游“云山石室”时题刻的。以表达对黄道周的人品与学识的评论。

山擎石室  海岛通源津  定是壹壶天景   副题：“转清渔东立” 。题刻于东门屿云山石室外石壁上。

吉能老师释之：作者借壹壶天景故事，形容山擎石室的神秘。壹壶天景故事，发生在顽石大仙的法宝 “天砂壶”之中，壶中天景若世外桃园，仙气缭绕，壶中内设莲池，不染阁，原为顽石大仙静修之居所，后来则成为囚居七位北斗星仙的禁地。道教用“壶天”比喻出入的仙境。渲染东门屿的云山石室犹如神仙出入的仙境，喻意尤深。

海滨邹鲁 题刻于东门屿南澳东坡巨岩上。宋体，每字高宽均1米左右，横书。前后分落款：“大清光绪丙戌仲冬（1886年农历11月）”，（湖南）宁乡吴芸、（湖北）楚南成心中、豫章张廷桢合题。

转述即悟 传能法师题刻于东门屿东明寺地藏阁右前方岩石上。

乐得苦难 传能法师题刻于东门屿东明寺地藏阁左前方岩石上。

天外奇观 作者不详。题刻东明寺前面石壁上。                  

西铭世泽 作者不详。题刻于东门屿文峰塔西边石碑上。孙吉能老师注释：“西銘”： 张载训辞篇名。张载（1020—1077），字子厚, 大梁（今开封）人。北宋大儒, 哲学家、理学家。理学支脉“关学” 创始人。为训戒学者，作《砭愚》、《订顽》之训辞（即《东銘》、《西铭》）。《西铭》提岀“民胞物与” 的泛爱论，把全民族看作一个大家族，说明个人的道德义务，宣扬“有，吾顺事，没，吾宁也，”的乐天顺命思想。

案山  作者不详。题刻于云山石室前方岩石上。“案山”：《 易经》中的风水术语。指好的风水地前面有低矮的山叫“案山” 。可以屏风把气，以守住龙脉。

达摩 题刻于东明寺大雄宝殿左方岩石上。       

觉岸 原东山县政协副主席黄成才题刻东明寺渡口岩石上。《本涅经》 说“佛者名觉，既自觉悟，复能觉他。” 佛教以迷喻海，以觉喻岸，由迷惘而入觉悟的境界谓觉岸。              

福海 原东山海关副关长何永城题刻于东明寺左侧岩石上。

东明寺周边的摩崖石刻还有：“圣晾”、“晨钟”、“枕潮”、“净智”、“龙”、“弥锋”、“坞堀湖”、“奋”、“喝云”、“ 观音”、“佛”、“ 经声”、“惟善得乐”、“得道”。